Ο Πάπας Φραγκίσκος απεβίωσε τη Δευτέρα του Πάσχα (21/04), σε ηλικία 88 ετών, από εγκεφαλικό επεισόδιο το οποίο προκάλεσε μη αναστρέψιμη καρδιακή ανεπάρκεια, σύμφωνα με την επίσημη ανακοίνωση του Βατικανού που εκδόθηκε αργά το βράδυ της ίδιας ημέρας.
Η επιβεβαίωση της αιτίας θανάτου ήρθε περίπου 12 ώρες μετά την αρχική ανακοίνωση της εκδημίας του Ποντίφικα, με τον Δρ. Andrea Arcangeli, επικεφαλής του τμήματος υγείας του Βατικανού, να επιβεβαιώνει το λυπηρό γεγονός του θανάτου.
Σε δήλωσή του, σημείωσε ότι ο πάπας Φραγκίσκος υπέφερε επίσης από επεισόδια αναπνευστικής ανεπάρκειας και είχε αμφοτερόπλευρη πνευμονία, καθώς και διαβήτη τύπου 2 αλλά και υπέρταση.
Στις 14 Φεβρουαρίου είχε εισαχθεί στο νοσοκομείο Gemelli με αναπνευστική κρίση που εξελίχθηκε σε διπλή πνευμονία. Νοσηλεύτηκε στην εντατική για κάποιες ημέρες, οπότε και η κατάστασή του σταθεροποιήθηκε.
Συνολικά παρέμεινε 38 ημέρες στο νοσοκομείο, η μεγαλύτερη σε διάρκεια νοσηλεία κατά τη διάρκεια της παποσύνης του.
Ο θάνατος του Πάπα Φραγκίσκου συγκλόνισε τη διεθνή κοινότητα και σηματοδοτεί το τέλος μιας εποχής για την Καθολική Εκκλησία, με παγκόσμιους ηγέτες και πιστούς να αποχαιρετούν τον Ποντίφικα που άφησε έντονο το αποτύπωμά του στον σύγχρονο θρησκευτικό και πολιτικό διάλογο.